在当选凉山州人大代表、四川省人大代表后，2013年，耿福能当选全国人大代表。深感责任重大的耿福能决心将群众真正关心、关注的“难点”“堵点”找出来，把具象化成建议提出来，有效推动相关问题早日解决。每天，耿福能以更加勤勉的工作态度和更加务实的实干精神，投入到履职实践中。
耿福能先后提交了“大力发展中药材种植，建立完整产业链，将巩固脱贫攻坚成果和乡村振兴有效衔接”“大力发展中医药现代产业体系”“支持发展中医诊所”“加快民族医药发展”等中医药相关的代表提案41件。在2020年5月十三届全国人大三次会议上，耿福能和张伯礼代表共同提出“中医药文化要融入中小学基础教育，中医药文化基因植入和传承要从娃娃抓起”的建议，引发强烈反响。
履职期间，耿福能走遍了大凉山。当地老百姓种什么，用什么样的模式才能让老百姓更挣钱，老百姓还有哪些困难，这些最实际、最直接的问题，都被耿福能写进了议案建议里。
耿福能所在的好医生集团将脱贫任务最艰巨的“三区三州”之一的凉山州作为主战场，助力脱贫攻坚并接续乡村振兴。2015年起，好医生集团参与到“万企帮万村”精准扶贫行动之中，在对口帮扶点凉山州布拖县乐安乡火灯村发展附子种植产业。经过多年的发展，好医生集团已经在凉山州9个县种植川续断、附子、金银花、木香、大黄、一枝黄花等中药材，面积达3万多亩，带动1.7万户8万多名农民稳定增收致富，并带动全国5个省种植中药材，累计投入达5亿元之多。
在2021年2月召开的全国脱贫攻坚总结表彰大会上，耿福能荣获“全国脱贫攻坚先进个人”的称号。2022年，好医生集团被授予全国五一劳动奖状。
乡村振兴战略开展以来，耿福能带领企业在凉山州开展中药材产业助力乡村振兴工作，积极投身“万企兴万村”行动，以“提供良种、负责技术培训、种出来的药材实行保底价收购”的方式推广中药材种植，同时，加强对种植户的技术培训，购买农业机械设备以提高生产力，全力建设标准化现代农业产业园区。
